Locked nucleic acid

A locked nucleic acid (LNA), often referred to as inaccessible RNA, is a modified RNA nucleotide. The ribose moiety of an LNA nucleotide is modified with an extra bridge connecting the 2' and 4' carbons. The bridge "locks" the ribose in the 3'-endo structural conformation, which is often found in the A-form of DNA or RNA. LNA nucleotides can be mixed with DNA or RNA bases in the oligonucleotide whenever desired. Such oligomers are commercially available. The locked ribose conformation enhances base stacking and backbone pre-organization. This significantly increases the thermal stability (melting temperature) of oligonucleotides. [cite journal
title=Thermodynamic, Counterion, and Hydration Effects for the Incorporation of Locked Nucleic Acid Nucleotides into DNA Duplexes
author=Kaur, H.
coauthors=Arora, A.; Wengel, J.; Maiti, S.

LNA nucleotides are used to increase the sensitivity and specificity of expression in DNA microarrays, FISH probes, real-time PCR probes and other molecular biology techniques based on oligonucleotides. For the "in situ" detection of miRNA the use of LNA is currently (2005) the only efficient method. A triplet of LNA nucleotides surrounding a single-base mismatch site maximizes LNA probe specificity unless the probe contains the guanine base of G-T mismatch. [cite journal
author=You Y.
coauthors=Moreira B.G.; Behlke M.A. and Owczarzy R.
title=Design of LNA probes that improve mismatch discrimination
journal=Nucleic Acids Res.
url=http://nar.oxfordjournals.org/cgi/reprint/34/8/e60?ijkey=IqLeijzpwQHCzit&keytype=ref |pages=e60


External links

* [http://lnatools.com A predictor for the physical properties of LNA modified oligonucleotides]
* [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=pubmed&dopt=Abstract&list_uids=15491130 LNA (locked nucleic acid): high-affinity targeting of complementary RNA and DNA]
* [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=pubmed&dopt=Abstract&list_uids=12573856 LNA: a versatile tool for therapeutics and genomics]
* [http://pubs.acs.org/cgi-bin/sample.cgi/nalefd/2005/5/i01/abs/nl048246f.html Alternative Nucleic Acid Analogues for Programmable Assembly: Hybridization of LNA to PNA]

Wikimedia Foundation. 2010.

Look at other dictionaries:

  • Locked Nucleic Acid — LNA Monomer. LNA (engl. locked nucleic acid) sind verbrückte Nukleinsäuren, in welchen der Zucker Anteil chemisch modifiziert ist. Struktur 3 endo Ko …   Deutsch Wikipedia

  • Locked nucleic acid — Acide nucléique bloqué Un acide nucléique bloqué ou Locked Nucleic Acid (LNA) est un analogue d acide nucléique contenant un pont méthylène entre l hydroxyle en position 2 et l atome de carbone 4 du sucre …   Wikipédia en Français

  • Nucleic acid — Nucleic acids are biological molecules essential for life, and include DNA (deoxyribonucleic acid) and RNA (ribonucleic acid). Together with proteins, nucleic acids make up the most important macromolecules; each is found in abundance in all… …   Wikipedia

  • Nucleic acid analogues — Not to be confused with degenerate bases. For phosphoramidite synthesis of nucleic acids, see Oligonucleotide synthesis. RNA with its nucleobases to the left and DNA to the right. Nucleic acid analogues are compounds structurally similar (analog) …   Wikipedia

  • Locked-Nukleinsäure — LNA Monomer. LNA (engl. locked nucleic acid) sind verbrückte Nukleinsäuren, in welchen der Zucker Anteil chemisch modifiziert ist. Struktur 3 endo Ko …   Deutsch Wikipedia

  • MicroRNA — The stem loop secondary structure of a pre microRNA from Brassica oleracea. A microRNA (abbreviated miRNA) is a short ribonucleic acid (RNA) molecule found in eukaryotic cells. A microRNA molecule has very few nucleotides (an average of 22)… …   Wikipedia

  • Рибонуклеиновые кислоты — Пре мРНК со стеблем петлёй. Атомы азота в основаниях выделены голубым, кислорода в фосфатном остове молекулы  красным Рибонуклеиновые кислоты (РНК)  нуклеиновые кислоты, полимеры нуклеотидов, в состав которых входят остаток… …   Википедия

  • Нуклеиновые кислоты — (от лат. nucleus  ядро)  высокомолекулярные органические соединения, биополимеры (полинуклеотиды), образованные остатками нуклеотидов. Нуклеиновые кислоты ДНК и РНК присутствуют в клетках всех живых организмов и выполняют важнейшие …   Википедия

  • Дезоксирибонуклеиновая кислота — Двойная спираль ДНК Дезоксирибонуклеиновая кислота (ДНК) макромолекула(одна из трех основных, две другие РНК и белки), обеспечивающая хранение, передачу из поколения в поколение и реализацию генетической программы развития и функционирования… …   Википедия

  • Треозо-нуклеиновая кислота — (англ. TNA, Threose nucleic acid, рус. ТНК)  искусственно синтезированный полимер, аналогичный ДНК или РНК. В природе не обнаружен. Остов ДНК и РНК состоит из сахаров дезоксирибозы и рибозы соответственно. В отличие от них, остов ТНК… …   Википедия

Share the article and excerpts

Direct link
Do a right-click on the link above
and select “Copy Link”

We are using cookies for the best presentation of our site. Continuing to use this site, you agree with this.